C.A.RE. – Η πρόταση της ΜΙΚΡΟΔΙΑΓΝΩΣΤΙΚΗΣ για tumor agnostic (αγνωστικιστικές) και κλινικά στοχεύσιμες αναδιατάξεις

Δρ. Γαρυφαλιά Καρπόνη

 

Clinically Actionable REarrangements

 

Υπόβαθρο

Οι αναδιατάξεις αποτελούν μια κατηγορία γονιδιωματικών αλλοιώσεων που είναι ελκυστικές τόσο ως θεραπευτικοί στόχοι όσο και ως διαγνωστικά εργαλεία, λόγω της εγγενούς έκφρασής τους αποκλειστικά στους καρκινικούς ιστούς. Ήδη, σε αρκετούς καρκίνους, αναδιατάξεις συγκεκριμένων γονιδίων είναι φαρμακολογικά στοχεύσιμες, ενώ αρκετές από αυτές, συναντώνται σε παραπάνω του ενός τύπου καρκίνου, ως εκ τούτου χαρακτηρίζονται αγνωστικιστικές (tumor agnostic).

 

Τι προσφέρουμε

-Έλεγχο αναδιατάξεων σε 49 driver γονίδια με NGS (βλέπε παρακάτω πίνακα)

-Σε επιλεγμένα γονίδια (ALK, FGFR2, NTRK1, NTRK2, NTRK3 και RET), το πάνελ μπορεί να εντοπίσει και νέες (novel) αναδιατάξεις (πέρα δηλαδή από των γνωστών βιβλιογραφικά προδιαγεγραμμένων αναδιατάξεων) μέσω της τεχνολογίας Exon tile imbalance

-Σε επιλεγμένα γονίδια (AR, BRAF, BRCA1, EGFR, MET, NTRK1 και RELA), το πάνελ μπορεί να εντοπίσει αναδιατάξεις εκτός των εξωνίων (intragenic exon rearrangements) και να προβλέψει με ακρίβεια κάποιο exon skipping, μέσω της τεχνολογίας RNA Exon Variant

AKT1 ERBB4 (HER4) MET NTRK3 RET
AKT2 ERG MTAP NUTM1 ROS1
AKT3 ESR1 MYB PIK3CA RSPO2
ALK ETV1 MYBL1 PIK3CB RSPO3
AR ETV4 NOTCH1 PPARG STAT6
BRAF ETV5 NOTCH2 PRKACA TERT
BRCA1 FGFR1 NOTCH3 PRKACB TFE3
CDKN2A FGFR2 NRG1 RAF1 TFEB
EGFR FGFR3 NTRK1 RARA YAP1
ERBB2 (HER2) MAP3K8 NTRK2 RELA

 

Απαιτούμενο δείγμα: Ιστός εγκλεισμένος σε κύβο παραφίνης (FFPE)

Χρόνος απόκρισης: 2 εβδομάδες

 

Επικοινωνήστε μαζί μας για περισσότερες πληροφορίες.

 

Γαρυφαλιά Καρπόνη, MSc, PhD

Μοριακή Βιολόγος-Γενετίστρια

Επιστημονικά υπεύθυνη Τμήματος Μοριακής Διαγνωστικής